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影响质粒提取的因素有哪些

2021.8.26

关于抽提质粒:
1) 抽提质粒时,加入 Solution II和 III后要求轻柔混匀。我个人觉得不用这样,只要不是
非常剧烈,可以快速混匀。尤其可以运用在一次抽提多管质粒的时候,这样可以快速,而且
效果一点也不差。
2) 抽提质粒时,用无水乙醇沉淀的时间可以由实验操作者来决定,如果时间充裕可以 30
min,否则 8-10 min 也可以。至于温度,个人觉得-20℃好于常温。如果加入可醋酸钠,会较
容易形成盐类杂质,所以时间短一些更好!
3) 质粒小提如果是用作鉴定或酶切,不必进行酚仿抽提,将溶液 1,2,3 离心后的清液移
入一个新的 1.5ml 离心管中,再次离心 3-5 min,小心取出上清液后,直接沉淀,不必担心
DNA 切不开,我已经这样使用一年多,没出过什么问题。当然这样的质粒不很干净,但是
做鉴定足够了。尤其是实验室女同胞们,可以减少酚仿的侵害,而且节省时间。
4)有时沉淀东西,由于沉淀量很少,离心完之后不知道到底有没沉淀下来东西,由于量很
少,不好观察,所以离心时建议按特定的方向放置离心管,这样你就可以在离心之前确定沉
淀该沉淀到管子的大致部位,这样离心后就可直接观察那有没有沉淀,避免满管子找,另外
看沉淀时可以对光看,这样就是颗粒状的细小沉淀也能看见的,我觉得我们制备好了一批感
受态,最好马上转化一种已知质粒。与此同时,取一点感受态接种到含抗性的固/液体培养
基培养来做对照。这样第二天即可以知道这批感受态是否还有外源质粒,又可以知道这批感
受态转化效率的高低。如果合格,那以后就可以放心使用!因为我也曾经遇到其实是因为感
受态不好而导致试验不成功,但是当时不知道,结果费时费力。
5)提取质粒的时候,最后一步的酒精挥发很关键,基本上是其后续的酶切反应的决定性因
素。所以这一步尽量挥发长一点时间,最好是空调吹热风,或是 37℃温箱放长一点的时间,
我试过室温过夜,酶切很好。
6)在做克隆鉴定的时候经常需要在酶切鉴定前进行 PCR 鉴定,每次配置 PCR 反应液很繁
琐,可以将其配置类似 Kit 的形式,按你需要的反应体系列表,然后放大 100 倍配置 100×
主反应液(100 次反应),其中含 Buffer,Mg2+,dNTPs,但不含引物和 Taq 酶,然后可以
10×分装或一管储存在-20℃,在需要的时候拿出融开,然后按所需的 PCR 反应个数吸取相
应的倍数,再补加相应反应倍数的 Taq 和引物,混匀后分装,这样做的好处如下: 1)节省
时间;2)避免每次反应加样不均的可能;3)大大减少 PCR假阳性的产生。

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