环孢菌素的作用机制
环孢素最主要的作用是降低T细胞的活性及T细胞所产生的免疫反应。
环孢素能与淋巴球（尤其是T细胞）细胞质中的蛋白质——亲环蛋白（cyclophilin）结合。包含环孢素与亲环蛋白的结合蛋白会抑制钙调磷酸酶（在正常情况下，会活化白细胞介素2（interleukin 2，IL-2）的转录）。活化T细胞受体会增加细胞内钙离子浓度，经由钙调蛋白将钙调磷酸酶去活化，接着去活化进一步将活化T细胞核因子（nuclear factor of activated T-cells，NFATc)去磷酸化，它便会进入T细胞的细胞核促使IL-2及相关细胞因子转录。环孢素与亲环蛋白相结合后，能抑制NFATc的去磷酸化；此外，环孢素还会抑制淋巴因子的生成及白细胞介素的释放。
环孢素会阻止线粒体膜通透性转换孔（mitochondrial permeability transition pore，MPTP）的开启，而抑制了细胞色素c（是一种强力促使细胞死亡因子) 的释放。虽然这个机转没有被拿来做临床用途，但对于细胞凋零的研究有着重大影响。
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