可是，这么多的化肥，并不意味着“物尽其用”。蒋高明说，这些化肥的平均利用率仅40%左右。其余的都被浪费掉，变成污染。除此以外，禽畜养殖业所造成的污染使得农业成为最主要的面源污染。

　　这造成了严重的双重损失。一方面，过度施肥使得农业面临严重的面源污染；另一方面，大量制造化肥，又产生严重的产能过剩。

　　蒋高明表示，每年国内工业化养殖动物所产生的27亿吨的动物粪便，因为种养分离的缘故，使得这些有机肥料不能得到很好回收。“两者的存在都是趋利的结果，但是最终受害的还是耕地与消费者。”

　　就其他农资而言，蒋高明举例说，我国农药的平均施用量13.4千克/公顷，其中有60%~70%残留在土壤中。1990年，农药施用总量约为70万吨，20年后，这个数字已经变成了170多万吨。每年我国约有50万吨农膜残留在土壤中，残膜率达40%。这些农膜的存在，使得在15~20厘米土层形成不易透水、透气的难耕作层。