3. NK细胞lncRNA潜在功能挖掘

   这些NK细胞特异表达的lncRNA有什么生物学功能呢?通过将lncRNA预测靶基因进行GO分析,研究人员发现这些lncRNA参与细胞毒性,细胞因子生成,分化等生物功能。进一步的共表达网络构建和验证也表明相关的lncRNAs与NK细胞的分化和功能密切相关。

   根据CD56和CD16表达,可以将NK细胞分为CD56bright和CD56dim,研究人员将不同来源的NK细胞CD56bright进行了lncRNA筛选检测。结果显示,CD56bright dNK, CD56bright pNK和 CD56bright cNK非常相似。其中,lncRNA AB128931在dNK和pNK细胞中高表达。生物信息学分析显示,AB128931的靶基因为CD56,来源于CD56的第一个内含子区域,命名为lnc-CD56。qRT-PCR验证显示,lnc-CD56在dNK中比pNK和cNK表达高,且与CD56的表达高度相关。进一步的在UCB/CD34+-derived NK 细胞中检测显示,lnc-CD56和CD56在细胞培养14d时表达丰度比较低,但在28d时,表达持续增加。因此,lncCD56可能在NK细胞初期过程非常重要,是一个潜在的NK细胞marker。