2015年11月，明瑞光教授带领福建农林科技大学等处的科学家们，通过对菠萝基因组进行测序，研究了“使多汁的菠萝植物能够生长在缺水环境”的基因和遗传途径。这一新的研究结果，发表在国际著名学术期刊《Nature Genetics》，对禾草植物的复杂进化历史，打开了一个新窗口，如高粱和水稻，它们与菠萝共有一个遥远的祖先。

在木瓜中，X连锁多样性的极度减少，与其他性别系统中观测到的形成鲜明对比，如人类和类人猿，或果蝇米兰达的neo-X染色体。X连锁性的多样性，被预测高于Y连锁的多样性，由于更强的遗传漂变和“搭便车”效应以及抑制重组。这项研究的证据进一步表明，多样性急剧减少发生在人类驯化之前，与之对比的是，Yh连锁的多样性，其通过雌雄同体性的正向选择发生在早期木瓜栽培过程中。

低的X连锁多样性是很强的选择性清除的产物，可能发生在12个半合子多外显子基因当中的一个。尽管不同的雌雄异株和雌性两性异体育种系统，X染色体却是高度相似的，并聚成一组。这与常染色体中观察到的两个亚组（雌性两性异体和雌雄异体）以及MSY、HSY区域中观察到的三个亚组，形成鲜明的对比。这项研究提供的资源，将加快木瓜性别决定基因以及其他性别特异性利益相关基因的发现。