密码子的设计实验
迄今为止,基因只是被用来在细菌中表达,因此不知道这种简单的策略是否也能在更高等的植物的转基因中发挥作用。在 CAPITALS 中的软件程序来自 DNALYSIS 软件的 DOS Compugene suite,可以从作者(W.M.B) 处获得运行在 Windows 下的版本。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。
实验步骤 | 1. 为了仿效一个高水平表达的植物基因的密码子频率,用 CODONS 程序计算了番茄Rubisco(核酮糖二磷酸羧化酶/加氧酶)小亚基的密码子。遗憾的是,这个单基因可能是一个太少太极端的样本,因为它没有每个密码子的样例。于是又加入了另外一个在植物中高水平表达的基因 [烟草花叶病毒壳蛋白(TMV) 的基因] 的密码子表和一个来自细菌但已知在植物基因表达中没有问题的基因 [也就是来自 Tn5 的 NPT-Ⅱ(卡那霉素抗性)基因] 的密码子表。CODONS 程序按顺序接受了这几个基因,然后自动创建一个总密码子表。 |
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