初步筛选以后，三部门将组织所推荐实验室参加能力考核与复核。筛选出的实验室将进入环境保护部将会同国土资源部、农业部发布的全国土壤污染状况详查实验室推荐名录，供各省（区、市）在详查工作中选用；各省（区、市）在详查工作中可以选用推荐名录中非本行政区域内的实验室。根据实际工作需要，将适时组织对详查实验室推荐名录进行增补。
根据环保部发布的《全国土壤污染状况详查实验室筛选技术规定》中所列分析方法，土壤无机污染物的检测主流仪器是ICP-AES、ICP-MS；土壤有机污染物主流仪器是GC-MSD；而农产品重金属检测主流仪器则是GAAS。
表：详查计划检测项目和采用的分析方法
表：实验室应配备的仪器设备基本要求