北仑河口湿地是重要国际候鸟通道，在候鸟迁徙季节，大量来往于西伯利亚、日本、朝鲜及我国北方与东南亚和澳大利亚之间的候鸟，途经该湿地，这一带沿海的红树林和滩涂成为了它们的重要中途歇息地。保护区共有全球性受威胁鸟类9种，其中濒危1种：黑脸琵鹭；易危8种：斑嘴鹈鹕、黄嘴白鹭、小白额雁、花脸鸭、青头潜鸭、白肩鵰、黑嘴鸥、仙八色鸫等。已有记录的鸟类中，有145种是候鸟，占鸟类总数的77.5%。据多年来的监测数据表明，每年飞抵越冬和途经该湿地的各种鸟类约有10万只以上。

　　北仑河口是中越两国交界的地方，北仑河口湿地的生态环境保护问题关系到国家的生态安全和国土安全的问题，对于维护我国领土和海洋权益具有重大意义。北仑河口国家级自然保护区管理处主任苏博表示，为加强北仑河口湿地的保护管理，保护区管理处大力开展公众红树林科普教育，提高公众的湿地保护意识；同时，着力推动多方参与，做到了政府、学校、企业、社区居民多方对北仑河口湿地进行有效社区共管。