接下来李老师通过具体的应用实例对上述各个特点进行了深入分析。在Top Down研究中，Q-Exactive可实现分子量高达47kDa的完整蛋白质的同位素分离，其一级和二级质谱都可以获得高分辨数据；在采用外标法分析E.Coli全细胞裂解物，其质量准确度达到1.5ppm（RMS）；HCD高能碰撞模式保证了TMT标记定量结果的准确性；Q Exactive还可利用SIM模式实现目标肽段的定量，具有独有的平行离子注入C-Trap和谱图叠加功能（MSX），实现了高采集速度、高灵敏度和高通量。

　　Q-Exactive在高分辨率（14万）、高质量准确度的基础上可同时保证高灵敏度、高采集速度；一个平台涵盖蛋白质组学的定性和定量要求，创新的HR/AM Quanfirmation功能，可在一次分析中完成包括发现、定量和确证3个工作流程；其定量灵敏度相当于三重四极杆，具备宽定量线性动态范围，并且具备完整的定性和定量流程。蛋白质组学研究中，对目标肽段/蛋白质的发现、相对定量、绝对定量和确认可在Q-Exactive同时实现。