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DNA测序仪的操作步骤

2021.6.10

  pcr测序反应

  (1) 取0.2ml的pcr管,用记号笔编号,将管插在颗粒冰中,按下表加试剂:

  所加试剂 测定模板管 标准对照管

  bigdye mix 1μl 1μl

  待测的质粒dna 1μl -

  pgem-3zf (+) 双链dna - 1μl

  待测dna的正向引物 1μl -

  m13(-21)引物 - 1μl

  灭菌去离子水2μl 2μl

  总反应体积5μl,不加轻矿物油或石蜡油,盖紧pcr管,用手指弹管混匀,稍离心。

  (2) 将pcr管置于9600或2400型pcr仪上进行扩增。98℃变性2min后进行pcr循环,pcr循环参数为96℃ 10s,50℃ 5s,60℃4min,25个循环,扩增结束后设置4℃保温。

  醋酸钠/乙醇法纯化pcr产物

  (1) 将混合物离心,将扩增产物转移到1.5ml ep管中。

  (2) 加入25μl醋酸钠/乙醇混合液,充分振荡,置冰上10min以沉淀dna。12 000r/min于4℃离心30 min,小心弃上清。

  (3) 加70%(v/v)的乙醇50μl洗涤沉淀2次。12 000r/min于4℃离心5min,小心弃上清和管壁的液珠,真空干燥沉淀10~15min。

  电泳前测序pcr产物的处理

  (1) 加入12μl的tsr于离心管中,剧烈振荡,让其充分溶解dna沉淀,稍离心。

  (2) 将溶液转移至盖体分离的0.2ml pcr管中,稍离心。

  (3) 在pcr仪上进行热变性(95℃ 2min),冰中骤冷,待上机。

  分析或打印出彩色测序图谱

  上机操作按仪器操作说明书安装毛细管,进行毛细管位置的校正,人工手动灌胶和建立运行的测序顺序文件。仪器将自动灌胶至毛细管,1.2kv预电泳5min,按编程次序自动进样,再预电泳(1.2kv,20min),在7.5kv下电泳2h。电泳结束后仪器会自动清洗,灌胶,进下一样品,预电泳和电泳。每一个样品电泳总时间为2.5h。电泳结束后仪器会自动分析或打印出彩色测序图谱。

  序列分析

  仪器将自动进行序列分析,并可根据用户要求进行序列比较。如测序序列已知,可通过序列比较以星号标出差异碱基处,提高工作效率。

  处理仪器

  测序完毕按仪器操作规程进行仪器清洗与保养。

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