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膜蛋白的结构形成过程研究

2020.4.06

1)膜蛋白的结构形成过程研究

成孔毒素(Pore-forming toxin, PFT)能在靶细胞膜上寡聚化形成穿膜通道, 破坏细胞膜结构并使其渗透性增强而导致细胞渗透性溶解。 PFT寡聚体在细胞膜上可以连接形成密排六方结构(hcp)。

Lysenin是来源于蚯蚓的一种PFT,可在鞘磷脂/胆固醇(SM/chol)双层膜结构中寡聚化并形成hcp。实验中,研究人员使用了日本RIBM的超高速视频级原子力显微镜(HS-AFM),对SM/chol双层膜结构中lysenin寡聚体组装成hcp的动态过程进行了实时成像,发现了hcp结构形成的规律。

研究人员将lysenin与SM/chol双层膜结构在云母为基底的环境下共同培养后使用HS-AFM进行成像。下图显示了lysenin寡聚体形成的hcp在膜结构上的分布。白色六边形表示一个hcp单元,箭头表示未完全形成的寡聚体。通过计算可以获得Hcp单元的间距和寡聚体直径等数据,与之前使用电镜的研究获得的数据一致。

通过HS-AFM还可以获得lysenin寡聚体的三维图像。对各个寡聚体的高度数据进行统计,可以发现高度分布主要为两种,高度较低的寡聚体已经嵌入了膜结构中,并可能形成了核孔。

接下来研究人员对400×300nm区域内的SM/chol双层膜结构上的lysenin组装过程进行了动态成像。图A展示了lysenin簇的形成并可以检测簇的增长方向(图B),最终组装形成hcp结构。 

在黑色的云母基底上也能观察到lysenin,分析双层膜结构上和基底上的lysenin半径大小可以得出,双层膜结构上的lysenin形成了寡聚体进而组成hcp结构,而基底上的lysenin处于单体或不规则聚集形态,无法形成寡聚体,这也与之前的研究结果一致。

对视野内的lysenin簇如B图进行划分并进一步分析可以得出:

1. Lysenin形成单个簇后,在双层膜上水平扩散,聚集排列形成hcp结构;

2. 新形成的簇会组成新的矩形排列(彩色矩形)或填充到已有的矩形排列的空缺处,有些已经形成的簇会在膜上扩散或分解;

3. 矩形排列的方向可变(如最上方红色矩形);

4. 绝大多数Lysenin簇在装配开始就会聚集形成簇,而不是随机分布在膜上。

HS-AFM还可以在更高的放大倍数下以更高速率成像,以实现对lysenin簇组装成hcp结构的动态进行更详细的检测。

通过对结果的分析可以得出,大部分从外围结合到hcp结构区域的簇会以平均0.45秒的时间分解,而已经形成hcp结构的则相对更加稳定,可能原因是内部的lysenin寡聚体相互之间具有更多的结合位点,更难以分解。

小结:高速AFM成像可用于lysenin形成hcp结构的动态过程的研究。lysenin簇于膜上形成,经过大量的分解\重组和扩散形成hcp结构,随着膜上hcp数量的增多而趋向于稳定。同时,我们还可以获得簇的高度信息,用于表征lysenin与膜的结合以及穿膜通道的形成。

 2)膜蛋白的结构形成机制研究

膜联蛋白(Annexin)是于真核细胞的细胞质内普遍存在的一种蛋白,与多种细胞膜功能相关,如胞吞、胞吐以及离子转运等。膜联蛋白在钙离子环境下可结合至磷脂,进行细胞膜修复等作用,但至今对于膜联蛋白-钙离子-磷脂三者的组装与分解的动态过程的研究仍处于空白。

这项研究中,研究人员使用日本RIBM的超高速视频级原子力显微镜(HS-AFM)引导了膜联蛋白V(A5)的组装与分解并进行成像,分析了过程中的蛋白结构,动力学和分子间相互作用。

研究人员首先将双层脂膜加入含2mM钙离子的缓冲液,再加入A5并用HS-AFM成像。可以观察到A5三聚体在膜上形成了六边形晶格结构(标记1),并在中间含有纵向高度更低的三聚体(标记2)或者空洞(标记3),这与先前使用其他AFM和电镜的结果相一致。


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