在真核生物中，miRNA参与多种生命过程，天然反义转录本是一类广泛存在于动植物基因组中的编码或非编码的RNAs分子，与正义基因互补，在转录水平或转录后水平调节正义基因的表达。但是目前，学界尚不清楚天然反义转录本与miRNA之间的调控关系。研究人员通过分析白菜和拟南芥全基因组和转录组测序数据及相关数据库，发现一系列MIRNA基因的顺式天然反义转录本，包括白菜中的BrpMIR398b-1和BrpMIR398b-2及拟南芥中的MIR398b和MIR398c；通过分析MIR398b/c和NAT398b/c在拟南芥植株中的表达模式，发现MIR398b和MIR398c在维管束组织中分别与其反义基因NAT398b和NAT398c共表达。研究人员培育过表达NAT398b和NAT398c的转基因植株，发现其转基因植株中pri-miR398b或pri-miR398c表达量和miR398水平显著降低，miR398靶标基因CSD1上调。人为降低其反义基因NAT398b和NAT398c表达水平，则分别增加pri-miR398b或pri-miR398c和miR398的积累，引起miR398靶标基因的下调，结果表明，IR398反义转录本调控miR398的生物合成。RNA酶保护实验表明，NAT398b和NAT398c转录本分别与pri-miR398b和pri-miR398c形成双链结构。若增加NAT398b/c的表达，植株叶片中pri-miR398b/c降解速率增加，pri-miR398b/c的表达量显著降低，表明NAT398b和NAT398c分别降低pri-miR398b和pri-miR398c的稳定性。研究人员通过sRNA深度测序，发现一些21 nt的nat-siRNA、人工过表达nat-siR398-1抑制pri-miR398b/c的表达。