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酵母细胞核制备实验——差速离心法

2019.4.08

细胞核(nucleus)是细胞中最大、最重要的细胞器(初中老教材认为细胞核不是细胞器,大学细胞生物学则认为是细胞器,这里以大学教材为准),它是由核膜(nuclear membrane)、核骨架(nuclear scaffold)、核仁(nucleolus) 几部分组成。

实验材料

酵母菌

试剂、试剂盒

细胞核缓冲液Ficoll缓冲液

仪器、耗材

匀浆机

实验步骤

1.  将酵母菌接种于YPD培养基(100 ml 到20 L),剧烈摇动或强制通气条件下培养至对数中期(OD600≈1~5)。培养物在预称重的离心瓶中于4℃, 1 500 g 离心5 min。

 

2.  确定酵母细胞的湿重,它与压紧的细胞体积大致相同。在所有的后续步骤中菌体的量将当作1体积来考虑。

 

3.  细胞用2~4体积冰水重悬,并立即于4℃,1 500 g 离心5 min,加入1体积含30 mmol/l DTT的酵母消解酶缓冲液重悬细胞、室温放置15 min。

4.  于4℃,1 500 g 离心5 min,菌体用3体积的酵母消解酶缓冲液重悬。

 

5.  在每毫升原压紧细胞中加入2 mg(200 U)酵母消解酶-100T,于30℃水平摇床以大约50 r/min 的转速温育40 min,通过水渗破法确定菌体是否完全转变为原生质体,如果原生质体化不完全,应继续温育直到完全。

 

6.  1 500 g 离心原生质体5 min,小心弃上清,原生质体球沉淀块不如细胞沉淀块般紧密。

 

7.  用2体积冰冷的酵母消解酶缓冲液轻轻重悬沉淀,原生质体1 500 g 离心5 min,重复2次。

8.  用0.5体积的细胞核缓冲液重悬细胞。

9.  将细胞悬液逐滴加入盛有15~25体积冰冷的Ficoll缓冲液的烧杯中,此过程在冰浴或冷室中进行,不断地振荡。

 

10.  将悬浮液转移到离心管中,于4℃,3 000 g 离心5 min,如果要完全除去细胞碎片, 重复离心几次。

 

11.  将上清转移至一个新的离心管中,于4℃12 000 g 离心20 min,沉淀用5~10倍体积的细胞核缓冲液重悬;再于4℃,12 000 g 离心。

 

12.  为了获得细胞胞核裂解液,用1体积裂解缓冲液重悬细胞核沉淀。

13.  用2体枳酵母消解酶缓冲液轻轻重悬沉淀,不要试图得到均一的悬液,只需将沉淀物从管壁上洗下来,悬转10~20次,于1 500 g 离心10 min 回收原生质体。

14.  用玻璃棒仔细将原生质体沉淀重悬于1体积裂解缓冲液中。

 

15.  在Dounce 匀浆器中用最紧密的研杵,冲击15~20次以裂解原生质体。

16.  往超离心管中加入一半管体积原生质体裂解液,再加等体积的抽提缓冲液,将离心管封口。于4℃在旋转轮或摇床上轻轻倒转离心管15~30 min。 


17.  于4℃,45Ti转子上100 000 g 离心90 min。收集上清,在100体积贮存缓冲液中透析2 ~ 4 h。将透析袋转移到100体积新鲜的贮存缓冲液中,再透析2~4 h。

 

18.  取出几微升透析液,用水作1 :1 000稀释,测定电导率。如果和类似稀释度的贮存缓冲液相等或低于一定值时(通常100~250 mmol/l NaCl),继续步骤19,否则继续透析。

 

19.  于4℃,10 000 g 离心10 min。收集透析液上清。分成小份放在液氮中冷冻,于 -80℃贮存。

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