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原位杂交(In Situ Hybridization,ISH)与荧光原位杂交(四)

2020.9.14

(2)硝酸纤维素滤膜吸印。

①将胶切成合适大小,切去右上角作为记号。

②将胶放进盛有变性缓冲液(1.5mol/l NaCl, 0.5mol/L NaOH)的盘中轻摇动15min。

③换到中和缓冲液(1mol/L Tris·HCl , pH8.0, 1.5mol/L NaCl)中轻摇动30min。

④裁一张硝酸纤维素膜,2~4张3MM滤纸和一些吸印纸(可用卫生纸),都与胶的大小相同(硝酸纤维素膜和吸印纸不能比胶大,否则易形成旁路),先将硝酸纤维素膜浸到水中,再放入10×SSC中,接触胶和硝酸纤维素膜时都要戴橡胶手套操作。



⑤平盘上放一块比胶大的平板(盛胶槽翻过来即可),上面铺一张3MM滤纸,起灯芯作用,盘中加少量10×SSC缓冲液(2.5cm厚),不能没过平板,使3MM滤纸充分饱和。

⑥将胶倒扣到3MM滤纸上。
⑦浸湿的硝酸纤维素铺在胶上,对齐,铺膜时从一边逐渐放下,防止产生气泡,有气泡时,可用吸管赶出,不能让膜与胶下的滤纸直接接触。

⑧膜上放一张3MM滤纸,不能与胶接触。

⑨上面加吸印纸及重物(500g左右)。

⑩通过滤纸的灶芯作用,平盘中的缓冲液就会通过胶上移,从而将DNA吸印到膜上,及时更换浸湿的吸印纸。在室温下转印过夜。

⑾去除上面的东西,用镊了将膜取出,在6×SSC中洗一下(也可不洗)。

⑿自然干燥,80℃烤2h。

⒀这时的膜就可进行杂交,或室温密封保存。

4.Northern印迹杂交(Northern blot) 这是一种将RNA从琼脂糖凝胶中转印到硝酸纤维素膜上的方法。DNA印迹技术由Southern于1975年创建,称为Southern印迹技术。RNA印迹技术正好与DNA 相对应,故被趣称为Northern印迹杂交,与此原理相似的蛋白质印迹技术则被称为western blot。Northern印迹杂交的RNA吸印与Southern印迹杂交的DNA吸印方法类似,只是在进样前用甲基氧化汞、乙二醛或甲醛使RNA变性,而不用NaOH,因为它会水解RNA的2’-羟基基团。RNA变性后有利于在转印过程中与硝酸纤维素膜结合,它同样可在高盐中进行转印,但在烘烤前与膜结合得并不牢固,所以在转印后不能用低盐缓冲液洗膜,否则RNA会被洗脱。在胶中不能加EB,因它为影响RNA与硝酸纤维素膜的结合,为测定片段大小,可在同一块胶上加标记物一同电泳,之后将标记物胶切下,上色、照像。样品胶则进行Northern转印,标记物胶上色的方法是在暗室中将其浸在含 5μg/ml EB的0.1mol/L 醋酸铵中10min,在水中就可脱色。在紫外光下用一次成像相机拍照时,上色的RNA胶要尽可能少接触紫外光,若接触太多或白炽灯下暴露过久,会使RNA 信号降低。从琼脂糖凝胶中分离功能完整的mR-NA时,甲基氢氧化汞是一种强力、可逆变性剂,但是有毒,因而许多人喜用甲醛作为变性剂。所有操作均应避免 RNase的污染。

下面介绍RNA甲醛凝胶电泳和吸印方法:

(1)试剂

10×MSE缓冲液:0.2mol/L 吗啉代丙烷磺酸(MOPS),pH7.0, 50mmol/L 醋酸钠,1mmol/l EDTA, pH8.0。

5×样品缓冲液:50%甘油,1mmol/l EDTA, 0.4%溴酚蓝。

甲醛:用水配成37%浓度(12.3mol/L)。应在通风柜中操作,pH高于4.0。

去离子甲酰胺。

50mmol/L NaOH(含10mmol/l NaCl)。

0.1mol/L Tris·HCl,Ph7.5。

(2)步骤

①40ml水中加7g琼脂糖,煮沸溶解,冷却到60℃,加7ml 10×MSE缓冲液、11.5ml甲醛,加水定容 至70ml,混匀后 倒入盛胶槽。

②等胶凝固后,去掉梳子和胶布,将盛胶槽放入1×MSE缓冲液的电泳槽。

③使RNA变性(最多20μg):RNa 4.5μl,10×MSE缓冲液2.0μl,甲醛3.5μl,去离子甲酰胺10.0μl。

④55℃加热15min,冰浴冷却。

⑤加2μl 5×载样缓冲液。

⑥上样,同时加RNA标记物。


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