万钢部长指出，要充分认识重大专项监督评估的重要性，通过监督评估保障国家目标的实现；通过监督评估督促各方管好资金、用好资金，提高科技资源的投入产出效率；通过监督评估推动体制机制创新，提高科学管理水平,探索完善市场经济条件下的新型举国体制，推动专项“十二五”组织管理上一个新的台阶。万部长强调，今年的重大专项监督评估将进一步体现专业化、规范化和科学化。各专项实施管理办公室积极配合本次监督评估工作，为监督评估组顺利开展工作提供保障，同时要求各专项以监督评估为契机，进一步理顺工作机制，保障专项“十一五”目标任务能够如期完成。
张晓强副主任强调，重大专项监督评估尤其要做好以下五个方面的工作：一要评估专项是否围绕国家目标，注重突破核心技术，为转变经济发展方式，大力培育发展战略性新兴产业提供科技支撑。二要分析承担任务的企业、高校和科研院所发挥作用的情况，推动和完善企业为主体的技术创新体系建设。三要进一步反映科技体制改革的有关情况，特别是促进产学研相结合等方面取得的进展。四要重视重大专项的组织管理，分析存在的问题和组织管理的不足，及时提出解决问题的方案和建议。五要探索建立长效的监督评估机制，总结经验，建立制度化、标准化的监督评估方式。
马俊如研究员代表监督评估专家作了发言。科技部重大专项办公室许倞主任在会上宣读了监督评估组成员名单，并对今年监督评估工作进行了具体说明。电子与信息、生物与医药、能源与环保和先进制造四个监督评估组分别召开了分组会议，讨论确定了专项自查汇报等事宜。各专项实施管理办公室主要负责人分别参与了分组会议，表示将积极配合重大专项监督评估工作，进一步完善专项管理，加快推进专项的实施进程。