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揭示重复序列对三维基因组区隔化的调控作用

2021.2.04

  Cell Research | 沈晓骅/孙育杰课题组合作揭示重复序列对三维基因组区隔化的调控作用

  哺乳动物基因组DNA全长近2

  m,经过多层有序组织与折叠后分布于直径5-10 μm的细胞核中。染色质高级结构对基因表达,细胞分化和胚胎发育起着至关重要的作用。其中,基因组A/B区隔化(A/B compartments)组织形式从纤毛虫(ciliates)到人具有保守性,表明基因组内存在物种间高度保守的驱动力。

  回归基因组构成的本质,蛋白编码区域只有不到2%,重复序列却构成了人(Homo

  sapiens)和小鼠(Mus musculus)超过一半的基因组,预示着基因组重复序列很有可能对染色质高级结构具有重要意义。LINE是人和小鼠基因组中丰度较高的一类逆转录转座原件,分别占据人和小鼠基因组的17%和19%,主要包含了L1(又称LINE1,LINE-1),L2和L3等类别,基因组中有超过500,000个L1的拷贝。

  2020年初,清华大学医学院的沈晓骅教授团队对L1、B1/Alu等重复序列的功能做了前期探究。对人和小鼠基因组中重复序列在的分布、对基因的表达调控以及对染色质高级结构的影响等方面积累了一些实验成果。


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