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非损伤性扫描离子选择电极技术及其在后基因组...(五)

2020.7.27

2.6. SIET的数据分析

自从SIET诞生以来,在数据分析方面一直是其较为薄弱的环节,在一定程度上也制约了SIET的推广和应用。这主要是由于各个实验室在离子电极的制作、电极的校正、电极的测量效率、电极相对于被测材料的位置、电极的运动方式定义以及缓冲溶液成份方面存在着或多或少的差异。而且,即使在同一实验室,由于某一因素的改变就将对最后的结果产生影响,从而很容易在数据分析上造成偏差,甚至错误[9]

许越等人针对上述问题,最近在SIET数据分析标准化方面做了一些尝试(见图6)[10],并设计了一套Internet多用户共享的数据分析软件-MageFlux。

2008052607.jpg
Fig.6 MageFlux: Web-interfaced SIET data analyses and 3D display software (based on [10], 2005).

图6.SIET数据分析标准化网上数据分析软件MageFlux-项目建立页面(根据文献[10]的图修改)。

(a)项目名称及说明;(b)电极相对于被测材料的空间位置;(c)以显示器为基准,电极的3维运动方向符号的选择以及电压差的计算方式;(d)不同离子电极的一些固有常数,如:离子扩散系数D0,离子电极测量效率eff,以及随试验不同而有所变化的部分,如:测量浓度梯度两点间的距离dr(图2中的dx),通过电极静态校正获得的斜率(Slope)和截距(Intercept)。

MageFlux通过将试验参数利用计算机软件进行跟踪和管理,不但将SIET数据的分析过程标准化,而且还可以将数据以三维动态交互式的形式展现在科研人员面前,真正将SIET技术的空间灵活测量方式体现了出来,并且为离子流动进出被测材料的精确定位提供了最直接和形象的依据。

3. SIET的应用

近年来,SIET为在生命科学各个方面的深入研究提供了一个崭新的工具。在扬格公司的网站(http://youngerusa.com/en/publications/siet.php)有较为全面的文献可供检索。鉴于本综述目的在于介绍SIET技术,应用SIET进行的具体科学研究请见相应的文献。在这里我们将重点介绍SIET技术应用的各个方面。读者还可以到扬格公司网址(http://youngerusa.com/NY/chinese/basics/04sanya_talk.php),收看许越在2004年全国生物膜与重大疾病学术讨论会上有关SIET演讲的实况录像。

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