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蛋白质糖基化的检测

2020.8.17

试剂、试剂盒 磷酸钠缓冲液蛋白溶液β-巯基乙醇NP-40 溶液

仪器、耗材 SDS-PAGE

实验步骤

一、用 PNGaseF(N-多糖酶)处理


1. 以 0.1 mol/L 磷酸钠(或 Tris-HCl,而不用柠檬酸)缓冲液,pH 7.4 ( 7.0~8.0 ) 配制高达 2 mg/ml 的蛋白溶液,并含 50 mmol/L β-巯基乙醇和 0.1% SDS,在水浴中煮沸 2 分钟。


2. 加 1/10 体积的 10% NP-40 溶液(或使 SDS 浓度少于或等于 0.17%,NP-40:SDS 的质量比在终反应中至少是 7:1)。


3. 加 PNGaseF 到终浓度为 6 mU/ml。注意这里的 1U 相当于在 1 分钟形成的 1 微摩尔产物;--些厂家用 1U = 1 nmole/分 在 37℃ 中保温 16 小时,以完全脱糖基化。


4. 用 TCA/DOC 按照下列步骤沉淀以制备 SDS-PAGE 样品。


(1) 在样品中加等体积的含 50% TCA 的 10 mmol/L DOC 溶液,并且在冰上放置 20 分钟。


(2) 以最大速度(16000 g),4℃ 下离心样品 15 分钟。


(3) 用冷丙酮清洗沉淀一次,并再次离心样品。


(4) 用 SDS-PAGE 样本缓冲液重悬最后的沉淀,如有必要,可用小体积的 1 mol/L Tris pH 8.0。将悬液调至 pH 8.0 样品上样至凝胶上进行电泳。


二、用 EndoH 处理


1. 在 100 mmol/L、pH 5.5 的柠檬酸钠缓冲液中制备浓度达到 1 mg/ml 的蛋白样品。


2. 用 10 mU/ml 酶 37℃ 消化样品过夜。


3. 按常规的方法处理样品用于 SDS-PAGE 分析。


三、酶去除 O- 多糖


1. 二甲胂酸钠(磷酸盐或马来酸盐,但不是 Tris-HCl ) 中制备浓度 5 mg/ml 的蛋白,pH 6~7.6。


2. 用 10 mU/ml 的酶消化样品,在 37℃ 孵育过夜。


3. 按照 PNGaseF 第 4 步所述的方法(TCA/DOC 沉淀)处理反应混合物以进行 SDS-PAGE。


四、来自产脲节杆菌的唾液酸苷酶


1. 以 pH 5.0、50 mmol/L 醋酸钠制备 0.5 mg/ml 的蛋白溶液。


2. 加 10 mU/ml 的唾液酸苷酶,37℃ 下保温 12~16 小时。


3. 制备样品用于 SDS-PAGE 分析。


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