该方法基于对特定改良品系高深度的重测序以及大规模的非改良群体基因组对照数据。使用ETAS analysis,
该研究组在著名的水稻改良品种，如高产的桂朝、优质的越光、抗旱的IRAT104中，鉴定出与这些改良品种对应的标签位点。进一步对陆稻IRAT104中的一个标签位点的深入分析发现，此位点在陆稻与水稻中具有很大的频率差异(61%
vs
3%)，且其附近具有显著的人工选择信号。功能分析表明，此位点落在脱落酸合成的限速酶NCED基因的编码区。在陆稻中高频的基因型引起了一个错义突变，改变了此酶的底物结合域的空间构象，从而可能影响了陆稻中脱落酸合成的效率。脱落酸是公认的植物抗性激素，它通过调节植物的渗透压、气孔关闭以及根系的发育，在植物的抗旱中扮演重要的角色。本研究的实验证实包含该标签位点的陆稻不仅具有显著更高的脱落酸水平，而且具有显著更发达的侧根系统，从而使陆生型水稻具有适应旱地节水耕作的优良表型。