关注公众号

关注公众号

手机扫码查看

手机查看

喜欢作者

打赏方式

微信支付微信支付
支付宝支付支付宝支付
×

Mosaic样品管理软件在样品管理与生物制药研发中...(二)

2020.6.08

保质期、污染

 

通常情况下,被检测的生物产品在室温下不稳定,或可能在冻融循环出现劣化、降解。这就要求在运输期间对储存条件进行精确跟踪和记录。Mosaic在样品通过工程流时对其冻融循环进行自动计数。生物产品面临的另一风险是微生物污染,尤其是对培养物上清液而言,因为培养物上清液按其定义即是处于营养丰富的培养基中。这可能需要将液体处理器设置在无菌环境中,例如设置在层流净化罩中,且其位置可能不同于其它自动化程序。而这些对Mosaic系统而言都不是问题,因为它的设计使其可与多个位置使用的自动化设备进行整合。

 

分析结果

 

在检测实验完成后,分析实验结果时很可能会需要实验板的布局信息,而利用Mosaic系统中的微孔板布局信息则能大大加快计算过程。依据不同的样品类型,Mosaic系统可将微孔板布局信息(物质、浓度、体积、孔位置)导出至专业分析软件(如IDBS公司的ActivityBase)。例如,生物样品和小分子化合物可能需要导出不同标识、浓度单位等。

 

 

201514143231608.gif

2Mosaic命令工作流示例 - 导出至ActivityBase的自动板视图

 

一个客户案例分享

 

在最近一个客户案例中,由于组织职能整合,其化合物管理小组被要求准备用于抗体筛选的assay-ready实验板。他们发现,除了准备传统小分子化合物实验板外,他们还需要准备大分子化合物实验板。在液体处理方面,该小组能够完成生物样品实验板实验所需的布局要求和浓度,但仅依靠人工加样方式和复杂的Excel表格来进行,还需专人对液体工作站进行编程控制。由于该小组已是Mosaic系统用户(用于小分子化合物管理),因此他们再次找到我们,准备将Mosaic系统扩展到协助制作、管理生物样品(抗体、siRNA)筛选的实验板。

 

输入和登记注册

 

抗体样品板最初提供给化合物管理组时随带附有电子表格,其中包含抗体的相关信息,但抗体未在别处进行登记注册。

 

第一步是要解决在Mosaic系统的登记系统中导入抗体板信息的问题。这一步的完成主要靠配置Mosaic的实验器具导入模块(Labware Importer),以识别含有相关抗体信息的Excel表。之后,简单导入所提供的Excel表,即可在Mosaic中同时登记注册抗体和其所涉及的微孔板。与小分子化合物一样,抗体样本在共存于同一Mosaic系统中,而Mosaic和外部注册系统可无缝整合。

 

工作流

 

该小组为此项任务建立了新的工作流,用以管理抗体的任意选取(cherry pick)和连续稀释。这些流程是按照Mosaic系统内现有的标准工作流步骤所建立,能帮助用户定义所需的各个加样步骤及目标板布局。例如(下图),有的板内布局是以4个孔为单位,按Z型浓度顺序进行的梯度稀释(图3)。

 

201514143247773.gif

 

3384Z型稀释微孔板布局


推荐
热点排行
一周推荐
关闭