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Nature:解析核小体的重塑机制

2013.5.27

  在细胞核中,基因组DNA紧紧包裹在核小体上形成染色质,但基因在如此紧密的包装中是无法表达的。现在德国慕尼黑大学LMU的研究团队,揭示了局部释放核小体DNA的分子机制,正是这一机制使染色体DNA得以转录。文章发表在本期的Nature杂志上。

  高等生物的细胞核负责储存基因组DNA,这些DNA环绕着由四种组蛋白组成的八聚体,形成碟状的核小体结构。基因组DNA以这样的形式包装成为染色质,使DNA受到良好的保护。但在这种紧密包装的状态下,介导DNA转录、修复和复制的酶难以接触到DNA,也就无法执行其正常功能。

  包括组蛋白分子伴侣在内的核小体重塑因子,负责令染色质保持动态,以便进行DNA转录等程序。这些因子能够局部修饰核小体结构,与组蛋白亚基相互作用,甚至能将紧密包装的DNA从核小体上解开。

  FACT复合体就是一种保守的组蛋白分子伴侣,是细胞分裂和DNA修复所必须的因子。FACT复合体能够识别核小体,并在DNA转录、复制和修复过程中确保染色质的完整性。FACT能特异性地与H2A-H2B组蛋白二聚体相互作用,这种二聚体是核小体标准结构的一部分。

  FACT识别H2A–H2B二聚体的能力,是其多种功能的核心。“然而,至今我们还不了解这些组蛋白的识别机制,也不清楚FACT与H2A-H2B相互作用对其功能有何影响,”LMU的Andreas Ladurner教授说。“因此,我们需要了解FACT识别核小体时的结构基础。”

  Ladurner及其同事首先分析了FACT 复合体上与H2A-H2B结合的区域(Spt16M)。“这为我们提供了FACT与组蛋白相互作用的一些线索,但这样的信息还不足以揭示核小体的识别机制,”文章的第一作者Maria Hondele说。“于是,我们又通过高分辨率的X射线晶体技术,分析了FACT与组蛋白二聚体结合时的结构。”

  晶体结构显示,FACT的结合阻断了组蛋白二聚体上的一个关键位点,该位点与DNA的亲和力很高。研究人员指出,Spt16M区域与组蛋白相互作用,使FACT逐渐侵入核小体,阻断组蛋白二聚体与DNA的接触。在此基础上,FACT使部分核小体发生重塑,增强了“核小体呼吸”现象,使局部DNA从核小体上释放出来,允许基因进行转录。“与传统观点不同的是,上述机制并不需要将DNA从核小体上完全解开,而是允许转录机器通过核小体,”Ladurner说。研究人员指出,正是借助上述机制,细胞核中的染色体装配才得以实现动态调节。

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