与此同时，稀土产业在冶炼分离环节也存在的分散度大，企业林立的局面，几乎每个稀土矿区都有独立的稀土冶炼分离企业。由于各地地方政府出于地方利益考量而施加的影响，这些分散的小企业过去也一直无法通过有效的市场规则进行重组和兼并，甚至有传言称，不少中小冶炼企业已经为国外下游稀土应用企业控制，这些国外企业有意维持目前中国稀土产业分散的现状。

　　一种普遍的观点是，众多分散的中小企业加剧了市场的竞争，而真正从中受益的则是国外的稀土应用企业。日本的精巧的电子产品，美国的军火生产长期以来都依赖中国的廉价稀土，中国稀土产量也一度占据世界95%的份额。但留给国内的，则是微薄的利润及被严重污染的环境。

　　为此，从2008年开始，中国政府开始出面整治稀土行业。为此，国土资源部加大了打击盗采的力度，商务部加大了对稀土产品出口的管制，而工信部则计划牵头组织稀土企业的整合。

　　由此带来的结果是，中国稀土产量的下降以及随之而来的出口下降。根据中国五矿化工进出口商会会长徐旭提供的资料，中国稀土出口由2003年最高的7万多吨下降到了2009年的不足五万吨。而业内人士估算，如果考虑到商务部及海关对稀土走私检查力度的加大，实际下降幅度要远高于这个数字。