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常用RNA标记方法介绍

2023.5.12

RNA标记方法:


按反应机制分如下四类:直接标记法,加尾标记法,基于逆转录反应的标记方法,基于RNA克隆扩增的标记方法。



常用于RNA标记的方法按标记物性质分为:


放射性同位素标记:32P、35S、3H


非放射性标记:半抗原荧光素化学发光物质



地高辛


地高辛标记RNA常用的方法是将DIG与UTP共价结合形成DIG-UTP,以DIG-UTP、ATP、CTP、GTP为底物通过RNA聚合酶T7、SP6经体外转录合成标记RNA。此法多用于RNA探针的制备,一般每20~25个核苷酸可引入一个地高辛分子。5'末端标记法5'末端标记法是通过化学方法将地高辛标记于寡核苷酸的5'末端。首先在5'末端连接上一个氨基连接臂残基,将合成的寡核苷酸纯化后,再使DIG-NHS与5'末端的氨基残基发生共价结合,从而形成标记RNA。DIG-RNA5'3'5'3'DIGAnti-DIG-APAP-DIG-RNA5'3'5'3'X光片曝光化学发光信号蓝紫色



生物素


用生物素标记RNA的方法常见的是用生物素与UTP结合形成Biotin-UTP,以Biotin-UTPATP、CTP、GTP为底物通过RNA聚合酶SP6、T7等经体外转录合成标记RNA。



荧光素


目前常见的荧光染料包括:异硫氰酸荧光素(FITC)四甲基异硫氰酸罗丹明四乙基罗丹明得克萨斯红藻红蛋白(PE)花青类染料(Cy3、Cy5)新型荧光素如量子点(半导体纳米晶体)。



点击化学


点击化学(Clickchemistry)是2001年诺贝尔化学奖获得者美国化学家Sharpless提出的一种快速合成大量化合物的新方法。该技术在诸多领域尤其是生物偶联技术和生物医药方面有广泛应用前景。


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