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PCR扩出来的条带亮度很弱是什么原因

2021.6.10

1. 模板的用量在你这种情况下应该和目的条带浓度关系不大——记得realtimePCR的原理图么,循环数够多时,目的片段的终浓度在不同模板量条件下相差不大;
2.首先考虑扩增效率问题,可用touch down PCR,除开头几个循环外,后面的退火温度降低一些,可提高扩增效率;
3.如果无效,建议使用两步法,95度 1min,(60-65)度 3min,可加入touch down 步骤;
4.不知道反应体系如何配置,应该是使用了GCbuffer吧?TaKaRa的GCbuffer(尤其是II)的确会降低一些扩增效率;
5.视你最终需要,如果是诊断目的,可多加一些Taq酶,也能增加扩增效率,但错配率和非特异扩增可能会增加。如果是克隆目的,其实目的条带暗一些很多时候并不影响最终实验结果。

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