靶向基因组编辑让研究人员能够在基因组中几乎任何位点引入精确的序列修饰。然而,研究人员指出,这些基因组修饰策略并不总是带来理想的结果。“精确的基因组修饰……取决于断裂是由NHEJ修复的,还是由HDR修复的。如果断裂由NHEJ修复,在断裂位点可能会引入小的插入或缺失。不过,若由HDR修复,就能引入理想的序列变化,形成特定修饰。”

  在这篇文章中,研究人员介绍,Pacific Biosciences公司的SMRT DNA测序带来15
kb的读长,实现了基因编辑频率的分析。在基因组编辑技术中,人们广泛使用有着长长一段同源臂的供体模板,以提高原代细胞的HDR效率。

  作者认为,SMRT DNA测序带来了以下优点:(1) 灵敏测定任何细胞类型中的基因组编辑,包括原代干细胞,而不需要构建稳定的报告细胞系;(2)
测定内源位点的修饰,而不管其转录状态如何;(3) 在使用携带长的同源臂的供体模板时,长的测序读长带来了清晰的DNA修复结果。

  此外,作者还提到:“我们的策略为研究DNA修复的通路提供了一种方法,而之前的方法难以研究。SMRT
DNA测序能够灵活评估任一位点的基因组编辑结果,而不需要开发报告系统,从而简化了基因组编辑项目的开发,也扩展了这些技术的应用。”