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蛋白质SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳-1

2020.9.01

【实验原理】

蛋白质在高于或低于其等电点的溶液中为带电的颗粒,在电场中能向正极或负极移动。当溶液pH值大于蛋白质等电点时,蛋白质带负电荷,在电场中向正极移动;反之则向负极移动,这种带电的颗粒在电场中泳动的现象称为电泳(electrophoresis)。不同的蛋白质由于等电点不同,在电场中的泳动速率也不同,因此应用电泳技术很容易实现对蛋白样本的分离与分析。

十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(sodium dodecyl sulphate-polyacrylamide gel electrophoresis, SDS-PAGE)是目前用于测定蛋白质亚基分子量的常规方法。聚丙烯酰胺凝胶是由丙烯酰胺和交联剂N,N'-甲叉双丙烯酰胺在引发剂(过硫酸铵)和增速剂(N,N,N',N'-四甲基乙二胺)的氧化-还原作用下聚合而成的。凝胶的有效孔径与它的总浓度T%成反变关系,在高浓度时,凝胶孔径小,可以筛分分子量小的多肽;低浓度时,凝胶孔径大,则可筛分大分子蛋白质。工作时,凝胶由浓缩胶和分离胶两部分组成,浓缩胶浓度低、孔径大,较稀的样品经过大孔径凝胶的迁移作用可被浓缩至一极窄的区带,以提高样品中各组分在分离胶中的分辨率。


SDS是一种阴离子去污剂,能断裂蛋白质分子内和分子间的氢键,使分子去折叠。还原剂二硫苏糖醇 (dithiothreitol, DTT)或巯基乙醇能使半胱氨酸残基之间的二硫键断裂。因此,在样本中加入SDS和还原剂后,蛋白质分子将被解聚为组成它们的多肽链,解聚后的氨基酸侧链与SDS充分结合,可形成带负电荷的蛋白质亚基-SDS胶束,所带的负电荷大大超过了蛋白质原有的电荷量,这就消除了不同蛋白质分子之间原有的电荷差异;然而,蛋白质亚基-SDS胶束的长轴长度与亚基分子量的大小成正比。因此,当这种胶束在SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳时,迁移率不再受蛋白质分子原有电荷的影响,而主要取决于蛋白质亚基分子量的大小。当蛋白质的分子量在15KD到200KD之间时,电泳迁移率与分子量的对数呈线性关系。

蛋白质SDS-PAGE常用于蛋白质分子量的测定,蛋白质纯度的分析,蛋白质浓度的检测,免疫印迹(Western Blot)的第一步,蛋白质修饰及免疫沉淀蛋白的鉴定等。

【器材与试剂】

1. 微型凝胶电泳装置  (如:Bio-Rad Mini-Protein Ⅲ型电泳仪),电泳电源,100℃沸水浴装置,Eppendorf管,微量注射器,带盖塑料染色盒,摇床。

2. 制胶试剂 丙烯酰胺(电泳级),N,N'-甲叉双丙烯酰胺,Tris碱,SDS,TEMED,过硫酸铵,DTT或α-巯基乙醇,甘油,溴酚蓝,甘氨酸,盐酸。

3. 染色/脱色试剂 考马斯亮蓝R-250,甲醇,冰醋酸

4. 储存液

(1)30%丙烯酰胺储存液:29.2g丙烯酰胺,0.8g双丙烯酰胺,加蒸馏水至100ml,储存于棕色瓶中,4℃保存1个月左右。(注意:未聚合的丙烯酰胺有神经毒性,须在通风橱内小心操作)。

(2)4 ×分离胶缓冲液100ml:75ml 2mol/L Tris-HCL(pH8.8),4ml 10% SDS,21ml蒸馏水,可在4℃存放数月。

(3)4×浓缩胶缓冲液100ml:50ml 1mol/L Tris-HCL(pH6.8),4ml 10% SDS,46ml 蒸馏水,可在4℃存放数月。


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