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Western Blot详解(五)

2020.7.13

CCC.Western Stripping Buffer的配方
解答:METHOD1
1、stripping buffer: 62.5mmol/l Tris PH6.7;100mmol/l beta-mercaptoethanol;2%SDS
二次发光protocol:1.stripping buffer洗膜:50度水浴30分钟,摇床上摇10-20分钟。
2、1*PBST洗:摇床上摇30分钟。
3、封闭,加一抗,二抗(同第一次发光)

METHOD2
(50ml总量):?-mercaptoethanol 342 μl;20% SDS 5 ml;Tris-Cl pH 6.7 3.125 ml;加ddH2O至 50 ml。
方法:将用过的膜浸入stripping buffer中,置50℃水浴箱中30min,间断振摇。之后用TTBS洗3*5min就好。此时你已经可以按新的转移好的膜来再次使用了。
该方法的优点:省事,省力,省钱,符合国际惯例。

METHOD3
1、beta-metaptoethanol 35ul
2、10%SDS 1ml
3、tris (0.5M,pH6.7) 625ul
4、dH2O 3.34ml
50-55℃,30min。

METHOD4
stripping buffer应该是可以放置很久的。不过我习惯于现配——毕竟,加了β-mercaptoethanol 以后太难闻了,配了就用;而且,有了现成的Tris-HCl缓冲液和SDS的母液,现配还是很方便的。每次用量5ml少了点,我每次用50ml。

METHOD5
0.5M NaCl,0.5M HAc;室温摇床15min。

METHOD6
将用过的膜泡在1*TBS中室温振摇过夜,中间可以换液2-3次,然后封闭,加一抗,二抗(同第一次发光),实践证明方法完全可行。

不管用那种方法,洗脱后都要用PBS或TBS再洗几次。

9.条件的摸索

DDD.用的是Santa Cruz的抗体,也实验过一抗和二抗肯定能结合,二抗加DAB肯定能显色。电泳的胶用考马斯亮蓝染色没问题,但是不知道与Marker对应的条带是否是我要的(我目的蛋白的分子量分别是55KD、29KD)。半干法2小时转膜后,丽春红染色发现大分子量蛋白转过去的较少。难道是裂解液出了问题?我用的是三去污剂,但没加叠氮钠和大概叫Apoptin的那种蛋白酶抑制剂。冰上裂解 -80度冻存的细胞,4度12000g离心5分钟,取上清,与分子克隆(第二版)上的加样buffer混合,沸水变性5分钟,上样。不知道是哪里出了问题?
解答:建议:1、首先确定您提的蛋白质量如何?可用PIERCE公司的BCA试剂盒测蛋白的浓度,一般来讲,其浓度应该在几-20微克/微升。
2、若是蛋白没问题,哪就看是不是电泳的问题,首先要看胶的浓度,您目的蛋白的分子量分别是55KD、29KD,建议分别用10%和12%的胶。60-80V,1小时左右。跑过积层胶与分离胶的线时,换用100V,3-4小时。
3、转膜,建议恒压,15V,不用转2小时,45分钟足以。您所说的大蛋白转过去的,并不是真正的少,而是因为在提的蛋白中大蛋白本身就很少。我曾经也转过2小时,但和45分钟的区别并不大。
4、根据MARKER的条带(我的是7条带:14、18、25、35、45、66、116KD),您根据MARKER的条带剪下25与35之间(29KD)的条带,45-66之间(50KD)的条带。这样第一,可以节省抗体,第二,您要的目的条带肯定在上面。
5、延长1抗、2抗孵育时间(我曾室温1小时,4度过夜),适当加大1抗浓度。
6、我买的也是Santa Cruz的抗体,我觉得质量还可以,我想您应该先找其他方面的原因。

EEE.电泳用的是恒流,一块胶,20mA,100分钟左右。转膜也是恒流,38mA,100分钟。而且我用别人的细胞和一抗在我的整个反应体系下做出来了,当然彼此的目的蛋白不同。所以,我想问题应该出在抗原和一抗上,不知对不对。
解答:电泳的条件:样品的分子量决定了胶的浓度,一般使样品跑至胶的中部即可。正常条件下,电泳时溴酚蓝和10kd左右蛋白跑在一起。由此可以决定电泳的电压和时间。建议你用恒压80-100伏。

FFF.BIO-RAD的半干转运系统有一个很致命的弱点就是无法控温(我用的就是这种),当电流过高,而系统的散热又比较差,滤纸的吸水性比较差的情况下,就很容易烧胶。
就转膜时,是采取恒压还是恒流的问题,我想和大家探讨一下,我感觉我这个系统用恒流很容易烧胶,我的胶有68cm2,用50mA恒流来转膜,刚开始电压就很高,有20 v左右,而用恒压,开始电流有110mA,但15min后,电流就降到8OmA,30min后就稳定在40mA,不就相当于恒流吗?
解答:恒流时电压逐渐升高的原因是湿滤纸逐渐变干因而电阻逐渐增大的缘故,如果电压升得太快,可以使滤纸更湿一些以克服。就我的感觉,20V的电流30min以后20Kd以下的分子丢失很多,不过我用的是小胶40cm2,不知有无不同。


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