目前，总站正在编制包括降水、土壤、固体废物、生物、放射性、噪声、恶臭、热辐射、光辐射、电磁辐射等分析方法，尤其是有机污染物、生物监测和连续自动监测的标准方法。
在我国环境监测事业发展的进程中，总站始终重视环境监测质量保证和质量控制工作，认真开展计量认证、持证上岗、质量控制考核等工作，在普及质量保证和质量控制基本知识、建立技术规范和监测方法、开展监测技术研究、研发环境标准样品与质控样品、开展质量控制工作检查等方面做了大量的工作，逐步形成了以技术培训、质控考核和检查为主线的环境监测质量管理模式，发挥着统领全国环境监测质量管理的重要作用。
据介绍，“十一五”末期，总站启动了以环境监测质量控制为研究方向的环境保护部重点实验室建设，计划到“十二五”中期，基本建成国家级环境监测质量控制技术平台，形成量值溯源/量值传递和环境监测仪器校准功能，以及质量控制考核和监督的技术实力。