在袁隆平看来，用来提高产量的转基因食品问题不大，但对用来抗病虫的转基因则要特别谨慎。
袁隆平说，现在有些转基因的食品，比如大豆，每年进口几千万吨，大家都在吃。我们现在正在把玉米的基因转到水稻上面来，目的是提高它的产量，这类转基因是可以吃的。但另外一些转基因是抗虫抗病的，这来自一种毒蛋白基因，虫子吃了要死，那么人吃了会怎么样呢?这才是大家最关心的事情。对于这类抗病虫的转基因食物，我们要特别小心，要反复做实验，在科学上证明它没有问题，才能够投放市场。“我的观点就是这样的，从来没有变。”袁隆平强调。
在中国发展高层论坛另外一场主题为“颠覆性技术：重塑商业模式”的对话中，多位业界人士认为，互联互通技术、基因技术等正是我们这个世界所面临的“颠覆性技术”，而“历史的垃圾箱里总是堆满了那些忽视颠覆者的灵魂”。
袁隆平在与中国经济网记者单独交流时表示，为了科学要有勇于冒风险的人。他说：“我愿意吃转基因食品，来做这个实验，但是问题是我已经不能生育下一代了。如果有人自愿做实验，吃转基因食品，看第二代甚至第三代会不会受到影响。那样的实验做了，如果证明都是健康的，那才是安全的。”