大科学装置科学研究联合基金成立于2009年，是国家自然科学基金委员会和中国科学院共同设立的，选择依托大科学装置的出发点是：突出共用性、弱化专用性、促进开放性、提升创新性，主要依托北京正负电子对撞机及北京同步辐射装置、上海光源装置、兰州重离子加速器与冷却储存环装置和合肥同步辐射装置。联合基金利用国家自然科学基金评审、资助和管理系统的优势，更好地吸引和调动全国高等院校、科研机构的力量，充分利用中国科学院承建的国家大科学装置为综合研究平台开展学科前沿研究、多学科领域、综合交叉领域研究。该联合基金的设立将更好地培养大科学装置科学研究人才，开拓新的研究方向，发挥这些大科学装置的综合平台效能，促进开放和交流，提升我国基础科学自主创新能力和我国在前沿科学领域、多学科交叉研究领域的源头创新能力，提升我国基础科学研究的创新能力和在国际上的学术地位，使我国基础科学研究更好地服务于国家战略需求。