二是发现南海形成过程中有多期次大规模火山喷发。钻探发现的多层玄武岩和多层火山碎屑岩，说明南海扩张形成的晚期曾有多期强烈的火山活动，南海的不少岛礁，其实就是覆盖在海山上的珊瑚礁。此项发现为研究海山的形成原因，以及海底如何停止扩张提供了全新线索。

　　三是发现南海深海盆反复变化的沉积历史。南海是个边缘海，周边陆地和岛屿送到海洋里的大量沉积物，最终归宿就是此航次所钻探的深海盆。在那里，科学家们发现大规模浊流沉积与多期次钙质超微化石沉积交替出现，而在大洋玄武岩基底上，科学家们还发现了数十米厚的黄褐色泥岩，这表明，南海形成之后经历了复杂多变的沉积环境，为研究南海乃至西太平洋的演变历史提供了宝贵证据。

　　李春峰说，尽管早已知道南海形成的奥秘就隐藏在深海盆地之下，但受科技条件限制，长期以来南海的深海盆地一直是科学考察的盲区。近三四十年来，对于南海大陆架和陆坡海底各国已经进行了大量科学考察，所打的石油钻井也超过了四千口，然而，南海中央水深超过四千米的深海盆地却从未钻探。IODP349航次正是第一次利用国际最先进的钻探技术，探索了南海深海盆地的演变历史。