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SDS法分离植物DNA

2019.4.23

实验概要

Dellaporta,Wood 和 Hicks (1983) 法分离植物总基因组DNA,通过实验掌握SDS法从植物叶片提取DNA 的原理和方法。

主要试剂

提取缓冲液 [ 详细信息:100mM Tris.Cl,;50mM EDTA; 500mM Nacl;40mmol/L 巯基乙醇,随用随加。]

液氮

异丙醇

TE缓冲液

无水乙醇

70%乙醇

KAC  [ 详细信息: 5mol/L KAC。]

主要设备

移液器

冷冻高速离心机

台式高速离心机

水浴锅

陶瓷研钵

离心管 [ 详细信息:离心管,50ml,有盖。]

离心管 [ 详细信息:离心管,5ml 和 1.5ml规格。]

小玻棒 [ 详细信息:小玻棒,弯成钩状的。]

 

实验步骤

1.  将2g经去淀粉处理的新鲜植物组织置于液氮中速冻,用研钵磨成细粉.

2.  将冷冻粉末转移至一50mL 离心管中并加入15mL提取缓冲液。轻轻旋转混匀。

3.  加入1mL 20% SDS,混匀,65°C保温10min 并不时轻轻旋转混匀(要点1)。

4.  加入5mL 5mol/L KAC,混匀后冰上放置20-30min(要点2)。

5.  25000g,4°C离心20min。

6.  上清用双层Miracloth纱布过滤,转移至一干净的50mL离心管中,加入10mL异丙醇,轻轻颠倒混匀,-20°C放置40min沉淀核酸。

7.  2000 g,4°C 离心20min,去上清,晾干沉淀5min。

8.  用700uL 50TE 缓冲液溶解沉淀并转移至一 Eppendorf 管中(要点3)。

9.  加入7uL RNase A 贮液,37°C保温1h。

10.  加入75 uL 3mol/L KAc,轻弹混匀,离心15 min沉淀不溶性杂质。

11.  将上清转移至一装有500uL 异丙醇的干净管中,轻轻混匀,室温下放置5min。

12.  微量离心机离心15min沉淀DNA,去上清并用500uL 70%乙醇清洗沉淀。再次离心5min,用巴斯德玻璃吸管吸去乙醇。

13.  沉淀物溶解于200uL TE 缓冲液中,4°C保存。

注意事项

1.  将SDS溶液加入到化冻的提取物中时,可能会有沉淀析出,要保证析出的SDS重新溶解,以及 65°C保温时提取物混合均匀。 

2.  在高浓度(>1 mol/L)的钾离子存在的情况下,十二烷基磺酸钠(SDS)会与蛋白或多糖结合变成不溶性的十二烷基磺酸钾复合物,这类复合物通常呈絮状,必须要经较高转速离心和Miracloth纱布过滤予以去除。

3.  若沉淀难于重新溶解,可在65°C加热10min。


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