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珀金埃尔默高内涵在脑切片中的应用

2021.3.08

随着单分子荧光原位杂交(single molecule fluorescent in situ hybridization,smFISH)以及RNAscope技术的发展,曾经仅用来观察细胞组织形态的大脑切片在神经领域科学家们的手中已经可以为我们展现单细胞水平丰富多彩的基因表达了。就像这样一切二标三成像四分析五测序:

描绘大脑皮层单细胞基因表达的自动化流水线


但一直以来,高内涵的粉丝们脑袋里面一定都是:我们高内涵哥哥速度超快,通量超高,表型筛选的一把手,拍摄和分析整合得天丝无缝,孔板是哥哥的好帮手……看到切片是不是有点蔫儿?别着急,只要有成像和分析的地方,我们珀金埃尔默高内涵团的哥哥们就是妥妥的流量担当。

今天,我就先给大家介绍Operetta CLS这个灵活的小可爱是怎么受到剑桥大学神经科学家们的青睐的。

8色高能光源,12滤光片带宽可选,五颜六色都可行:

中下丘脑中间隆起(ME)的少突胶质细胞smFISH联合酪胺信号放大技术(TSA)六色成像


水镜的力量,更大的通光量,更好的分辨率:

40X水镜下海马区星形胶质细胞的成像


XYZ轴的智能预扫描,省时省力省空间:

人大脑切片的5X预扫描与Region of Interesting,ROI 40X成像(DAPI & smFISH)


强大的Harmony全方位分析软件,智能的组织分区,准确的神经细胞分类,轻松的RNA spot定量

Harmony自学习区分组织区域及细胞分类


围绕着快速高质成像与深度分析定量统一整合的高内涵核心,Operetta CLS在组织切片的成像和分析中展示出了其强大的能力。利用这样的方法,仅2020年3月,以David H. Rowitch 团队为主的剑桥大学神经科学家们, 3号在线发表了一篇Cell Metabolism IF: 22.415;4号在线发表了一篇Neuron IF:14.403;16号在线发表了一篇Nature Neuroscience IF:21.126,还有一篇预印本等待发表。文中的图片和方案全部来自于这些高水平文章。

所以,大家还在等什么呢,神经领域,大脑切片,Operetta CLS,和剑桥大牛们一起,粉它!

Operetta CLS


参考文献
1. Bayraktar, O.A., et al., Astrocyte layers in the mammalian cerebral cortex revealed by a single-cell in situ transcriptomic map. Nat Neurosci, 2020.
2. Cheng, W., et al., Calcitonin Receptor Neurons in the Mouse Nucleus Tractus Solitarius Control Energy Balance via the Non-aversive Suppression of Feeding. Cell Metab, 2020. 31(2): p. 301-312 e5.
3. Smith H L, Freeman O J, Butcher A J, et al. Astrocyte Unfolded Protein Response Induces a Specific Reactivity State that Causes Non-Cell-Autonomous Neuronal Degeneration[J]. Neuron, 2020.
4. Kohnke S, Lam B, Buller S, et al. Nutritional signals rapidly activate oligodendrocyte differentiation in the adult hypothalamic median eminence[J]. bioRxiv, 2019: 751198.
 


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