固有免疫-黏膜的免疫作用
机械作用
管腔(如消化道、泌尿道)里流动的体液可以将微生物冲刷到体外。因此，一定程度的腹泻、尿频或咳嗽具有自我保护意义。 黏膜分泌粘液，可以粘附各种微生物，阻止它们粘附到上皮细胞。然后借助纤毛摆动、管腔蠕动以及咳嗽等的机械作用，将微生物清除。 黏膜的上皮组织也提供一定的机械屏障作用。但黏膜的上皮组织多为单层结构，缺乏角化，机械屏障作用比皮肤弱。
化学作用
某些管腔含有的体液具有杀菌物质，如胃腔含有的胃酸可以杀死伤寒杆菌等。 粘液含有溶菌酶等多种杀菌物质。
生物拮抗作用
有些黏膜表面寄生着正常菌群，可以拮抗病原体的入侵。其机制有： 产生代谢废物：如，阴道乳酸杆菌分解阴道上皮细胞里的糖原，产生乳酸抑制白假丝酵母菌的生长。因此清洁阴道方法不当、长期使用抗生素可导致阴道炎；老年女性阴道上皮萎缩，糖原生成不足，可出现老年性阴道炎。 产生细菌素：如，大肠埃希菌产生大肠杆菌素，可在敏感菌的细胞膜上形成孔洞，破坏细菌的能量代谢。
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