MHC在免疫应答中作用
MHC-I和MHC-II除了结构有异外，它们的主要区别是在免疫应答中激活机制和效果不同。
病毒侵入细胞内后，利用细胞合成出蛋白质，这些蛋白质或一些片段穿过细胞膜，与膜上的MHC-I分子结合，形成MHC-抗原复合物，从而激活细胞毒性T细胞。Tc细胞一方面通过自我繁殖复制出大量相同的Tc细胞，一方面一部分分化为记忆细胞。这些Tc细胞与靶细胞结合，分泌穿孔素杀死被病毒感染或变易的细胞。
细菌、寄生虫等体积较大，被巨噬细胞吞噬之后，一些抗原分子穿过细胞膜，夹在MHC-II分子沟中。巨噬细胞将抗原提呈给TH细胞,于是激活TH细胞。TH细胞一方面激活Tc细胞使发挥杀伤作用，一方面刺激表面与MHC-II-Ag结合的B细胞，使转化为记忆细胞和浆细胞，大量分泌相应的抗体。
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