为完成“十一五”污染防治工作任务，要将全面改善环境质量作为污染防治的根本任务，将以防为主防治结合作为污染防治的根本方针，将全面推进重点突破作为污染防治的根本方法，将减少污染物产生作为污染防治的根本途径，将综合运用法律、经济、技术、行政和信息公开等措施作为污染防治的根本手段。
2009-2010年要努力完成以下八个方面工作：
一、毫不松懈地抓好饮用水环境安全保障工作，着力解决危害群众健康的突出环境问题
（一）扎实做好饮用水环境安全保障基础工作。继续做好饮用水水源保护区划分与调整工作，2010年年底前，完成所有城镇集中式饮用水水源保护区的划定工作。深化全国饮用水水源地基础环境调查及评估，在城镇调查的工作基础上，进一步调查评估典型乡村饮用水水源地环境状况。
（二）编制和实施饮用水源保护规划。认真落实《全国城市饮用水安全保障规划》。完成《全国城市集中式饮用水水源地环境保护规划》和《全国地下水污染防治规划》的审核报批并督促落实。逐步加强农村地区饮用水水源保护工作。