微生物资源是地球上最大的、尚未充分开发利用的自然资源，是现代生物技术产业发展的重要源泉。我国微生物资源极为丰富，菌种保藏量也相当可观，在应用微生物学研究方面已有一定的基础，但在资源规范管理、开放共享和功能开发方面依然存在很多问题。通过建设应用微生物研究网络，中科院将充分发挥院内有关研究所在不同研究领域中的优势和特长，整合应用微生物研究的核心力量，扩大我国微生物资源的战略储备，促进资源、信息和技术的开放共享，整体提升我国应用微生物研究水平，更好地发挥微生物资源和技术在支撑生物产业发展和满足国家重大需求方面的作用，推动国民经济和社会的可持续发展。
此次会议的召开，标志着中科院应用微生物网络已从规划筹备阶段进入全面推进阶段。今后，网络各单元将在统一的管理模式和运行机制下开展工作，建设符合国际标准的、资源、信息和技术合作共享的研究网络体系。