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布鲁克和Radboudumc TML成立转化组学联合卓越中心

2019.4.18

  分析测试百科网讯 2019年4月16日,在荷兰X-omics计划的开幕活动中,布鲁克和拉德堡德大学医学中心(UMC)转化代谢实验室(TML)宣布为转化组学成立联合卓越中心(CoE)。 在Alain van Gool教授的领导下,联合卓越中心将专注于使用各种组学方法进行创新代谢分析的临床转化。该合作将围绕TML近期购买使用的timsTOF Pro超高灵敏度、捕集离子淌度四极杆飞行时间质谱仪开发4D组学方法。

  拉德堡德大学医学中心转化代谢实验室是一个超过100人的诊断研究实验室,也是实验室医学系的一部分,该实验室专门将代谢研究转化为生物标记物,用于个性化诊断。由van Gool教授领导的研究旨在填补分析科学与临床需求之间的差距,包括疾病理解、诊断和各种治疗领域的随访。该实验室使用多种布鲁克质谱技术,包括ESI-和MALDI-TOF。 最近,TML通过添加用于糖肽分析的timsTOF Pro 4D组学系统来加强其科学能力,以加速临床生物标志物的开发,并探索健康和疾病中的蛋白质糖生物学。

  根据CoE协议,布鲁克和TML打算合作开发利用捕获离子迁移率衍生的碰撞截面(CCS)值的4D糖蛋白质谱分析工作流程,以增加基于糖肽的生物标记物的开发。布鲁克将提供专业知识、早期软件访问和定制,以便在timsTOF Pro上开发以CCS为重点的糖蛋白组学工作流程。

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图1:Alain Van Gool博士(右)和Hans Wessels博士(左)在拉德堡德大学的蛋白质组学实验室

  布鲁克生命科学质谱执行副总裁Rohan Thakur博士评论说:“布鲁克多年来一直在与TML合作,我们很高兴van Gool教授决定使用timsTOF Pro开发新的4D多组学方法,这些方法可以直接影响患者护理。我们相信,源自糖肽特异性CCS信息的信息可以帮助填补生物标志物发现和验证之间的空白,加速实验室临床试验的开发。”

  Alain van Gool教授说:“我们过去与布鲁克的合作对我们的转化临床诊断研究很有价值。我们看到timsTOF Pro具有高灵敏度,结合捕获离子淌度分离能作为我们研究平台的有效补充。高速和高灵敏度的离子淌度分离具有不同糖型的糖肽的能力为我们的糖肽生物标志物的发现工作增加了另一个维度。我们期待布鲁克在CoE协议下用这些新的4D组学功能提供更多支持。”

  TML高级蛋白质组学研究员Hans Wessels博士补充说:“CoE支持的新颖的timsTOF Pro 4D组学技术强有力地支持了我们推进创新患者护理的努力。我们相信,工业合作伙伴和学术界的共同努力可以加速转化科学,这些努力将有助于开发符合最终用户需求的新技术。我们与布鲁克的合作在过去几年中已经具有很大价值,通过相互间专业知识交流来开发和实施新技术。得益于ZonMw媒体投资计划和Radboud UMC的财政支持,最近我们的实验室安装了timsTOF Pro,更如鱼得水。”

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图2:在Radboud UMC TML,结合nanoElute的timsTOF Pro上为4D 组学研究提供支持

  采用timsTOF PRO和PASEF的新型4D组学研究

  独有的timsTOF Pro系统采用PASEF(并行累积串联碎片)方法,通过捕集离子淌度(TIMS)的实现,为4D鸟枪法蛋白质组学提供业界领先的速度。timsTOF Pro独特的双TIMS几何结构与TIMS设备中离子的时间空间聚焦相结合,意味着PASEF模式提供的速度优势同时提高了灵敏度和定量能力。所有这些在速度、灵敏度和定量方面的优势都保持了布鲁克高性能QTOF质谱仪的优势,包括MS和MS/MS快速采集模式下全质量范围的高分辨率(即使在最高采集速率下的分辨率为50,000 FWHM),ppm精确质量,和高同位素保真度(真同位素模式,或TIPTM)。强大的timsTOF Pro性能与PASEF采集模式为科学家们提供了深入研究复杂细胞机制的有力工具,促进低丰度并具有重要生物学意义的肽段或蛋白质的发现,或在转化蛋白质组学研究中验证它们。

  关于拉德堡德大学医学中心

  拉德堡德大学医学中心(Radboudumc)是一所学术医院,隶属于Radboud大学,位于Nijmegen(荷兰)。我们专注于奈梅亨的患者护理、科学研究、教学和培训。我们的使命是能影响到医疗保健领域。我们的目标是成为塑造未来医疗保健的先行者。我们以人为本,用创新的方式与线上工作密切结合。Radboudumc拥有超过11,000名员工,3,300名学生和200名博士,是荷兰领先的最大的医疗中心之一,为荷兰东部的居民提供超区域三级医疗服务。我们的基础研究设施包括18个技术中心和3个研究机构:Radboud分子生命科学研究所,Radboud健康科学研究所和医学神经科学捐赠中心。它们共同涵盖十八个重点突出和互动的研究主题,每个主题旨在开发“个性化医疗保健”保护下个性化预防,诊断和治疗策略的工具。

  更多信息:www.radboudumc.nl

  关于荷兰X-omics计划

  转化代谢实验室(TML)是拉德堡德大学医学中心(Radboudumc)实验室医学系的一部分。TML领导了最近启动的荷兰X-omics计划,该计划是大型研究基础设施国家路线图的一部分。其部分由NWO资助,总预算为4000万欧元,旨在在荷兰建立一个X-omics研究基础设施。通过加入并提供基因组学,蛋白质组学,脂质组学,代谢组学和数据整合与分析方面的优秀设施,研究人员可以在他们的项目中使用最新的X-omics技术,并推动分子生物学的新见解。

  更多信息:www.x-omics.nl

  关于布鲁克公司(纳斯达克股票代码:BRKR)

  布鲁克的产品帮助科学家不断取得突破性进展,并开发出能够提高人类生活质量的全新应用。其高性能科学仪器以及极具价值的分析诊断解决方案使科学家能够在分子、细胞和微观层面上探索生命和物质。通过与客户紧密合作,布鲁克在生命科学分子研究、应用材料与制药行业应用、显微技术、纳米分析及工业应用领域中不断取得创新并显著提高了生产力,同时帮助客户取得成功。近年来,布鲁克还成为了细胞生物学、临床前成像、临床表型组学与蛋白质组学研究、临床微生物学及分子病理学研究领域的高性能系统供应商。

  欲了解更多信息,请浏览公司网站:www.bruker.com.cn


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