与身高、体重等复杂的性状一样，行为这种性状很有可能也是受到成百上千个作用很小的遗传元件整体作用的部分影响的一种性状。有人曾经试图通过对一整个家族成员进行研究来寻找这些遗传元件，可最终还是失败了。他们曾经寻找过与性状共遗传(coinheritance)的遗传标志物;也曾经对与已知的神经生物学性状、或者是可能与这些神经生物学性状相关的候选基因进行过研究，可惜基本上都没能取得成功。全基因组关联研究能够检测某一个性状是否与成百上千、甚至是数百万个突变中的某一个突变有关。目前对于全基因组关联研究基本上已经达成了共识，即对于非行为类别的性状，这种方法非常管用，不过需要提醒的是，这种方法只能够发现很少数的突变位点，并不能找出所有的相关位点。可是除了少数几次好运气之外，在对体重、身高和某些疾病的分析工作中，全基因组关联研究几乎都是一无所获的。
这可能是因为行为和其它的性状不太一样，它并不受遗传调控。对于自闭症(autism)和精神分裂症(schizophrenia)，有很大一部分致病遗传缺陷可能都属于非常罕见的突变，其中有一些突变可能还是突然新出现的，所以根本无法通过全基因组关联研究发现它们。使用全基因组关联研究只能发现已知的、比较常见的突变。另外，这些突变对行为的遗传影响作用都非常小，要比我们预计的小得多，而且这种突变的数量又要比我们预计的多很多，所以我们很难发现这些数量众多、但是作用却又微不足道的遗传突变。