食品安全与公共健康是近年来世界各国共同面临的热点问题，而抗生素抗药性致病菌感染的快速上升和抗药性基因转移严重威胁人类健康，给保健系统带来沉重负担。食源微生物，尤其是大量非病原菌，包括益生菌已成为人类及动物体内菌群获取抗药性基因最普遍的渠道。多项今天仍在推广的旨在减灭抗药性的措施，包括很多广泛使用的益生菌事实上不仅无益反而加速了抗药性基因的传播。这些开创性发现揭示了深层次的食品安全及公共健康的新挑战，更显示了尽快纠正错误观念及行为的迫切性，强调了农业和健康、研究和生产缺一不可的全球合作在控制抗生素抗药性及保障公众健康方面的必要性。应对挑战，国际控制抗药性研究理念包括联合国粮农组织的政策正在进行全面改进。通过高校、研究机构、政府机构、农产品生产与加工企业、及医药企业等的全面合作来实现全方位有效控制微生物生态系统中的抗药性基因传播，为提升全球食品安全及公共健康水平打下基础。