肿瘤免疫火得飞起，更新后的TIMER 2.0数据库真心好用！
肿瘤微环境中免疫细胞的组成和丰度是影响肿瘤进展和免疫治疗效果的重要因素。由于直接测量方法的局限性，计算算法通常用于从肿瘤转录组图谱推断免疫细胞组成。这些估计的肿瘤免疫浸润人群与肿瘤的基因组和转录组学变化相关，提供了对肿瘤免疫相互作用的见解。今天我们就一起来看这个肿瘤免疫分析的又一神器——TIMER 2.0数据库。
TIMER 2.0数据库（http://timer.comp-genomics.org/）的开发者来自哈佛大学和四川大学，数据库相关文章（PMID: 32442275）于2020年7月发表在Nucleic Acids Research杂志（2019IF=11.501）上。截至2021-04-15该数据库相关文章已引用74次（数据来源：PubMed）。
开发者在之前版本的基础上进行了改进，TIMER 2.0使用六种最先进的算法，为癌症基因组图谱（TCGA）或用户提供的肿瘤概况提供更可靠的免疫浸润水平估计。TIMER 2.0提供了免疫（Immune Association）、探索（Cancer Exploration）和评估（Immune Estimation）三个模块用于调查免疫浸润与遗传或临床特征之间的关联，以及四个模块用于探索TCGA队列中与癌症相关的关联。每个模块可以生成一个功能性热图表，使用户可以轻松地同时识别多种癌症类型的重要关联。
需要注意的是由于当前运行中用于批校正的可用TCGA样本的数量不同，TIMER 2.0的估计分数可能与以前版本的TIMER略有不同。
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