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WB上层胶怎么算跑好了

2022.4.02

检测器检测。
理论上,从普通培养基中收集分泌蛋白,此时对细胞生长条件的影响最小,是最佳的实验条件:但是这存在隐忧。因为含血清的培养基中含有非常丰富的BSA(牛血清白蛋白)之类的蛋白质,除非你进一步分离纯化,否则直接用这种样品去WB会有非常大的麻烦,尤其当你的蛋白在60-46kDa之间的时候:用“任何”抗体去检测这一区间的蛋白,会有一片常强的信号。
因为此区间蛋白(主要是BSA)浓度过于富集,会非特异性粘附“任意”抗体从而最终被识别。同理,采用SDSLB裂解细胞制备样品前,通常要用PBS洗涤,其目的之一是去除培养基中的BSA。
采用无血清培养基收集细胞上清除了改变细胞的生理状态外(可能激活未知信号途径,诸如AKT等),还会出现的问题是:
1.即使采用了无血清收集上清,仍然有大量杂蛋白,但相对好很多。
2.选用了上清,由于蛋白浓度太稀,通常要采用TCA沉淀富集,再重新溶解。
3.TCA沉淀对半定量操作要求非常高,因为很容易沉淀不充分或者离心操作丢失,尤其在离心过程,离心管的摆放非常讲究,要180度翻转离心两次。重新溶解时,由于蛋白需要在一定的盐离子条件下才能重新溶解,你要摸索充分溶解的条件,相对麻烦。
实际上,如果你不是非常强调蛋白的分泌有什么生理功能,一般不建议检测上清,尤其半量的WB实验检测不同样品间的差异。这里面有实验操作细节的麻烦-经验之谈,我经参与的cancer cell 文章所研究的蛋白就是分泌型蛋白,但90%的数据是celllysis:偶用到上清,也只是作为富集纯化该蛋白的原料,为进一步分析做准备。

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