刚果红染色法的方法
常用的刚果红染色法有两种
方法一,先培养微生物，再加入刚果红进行颜色反应
在长出菌落的培养基上，覆盖质量浓度为1 mg/mI。的CR溶液，10～15 min后，倒去CR溶液，加入物质的量浓度为l mol/l的NaCI溶液，15 min后倒掉NaCl溶液，此时，产生纤维素酶的菌落周围将会出现透明圈。
（加NaCl的原因：刚果红是结合到培养基的多糖底物，但分解纤维素的细菌可以产纤维素酶，能分解这个多糖底物成为寡糖，这样刚果红就不能结合上去了，氯化钠就可以使结合不牢的刚果红洗去，这样就留下大小不一的透明圈，大的透明圈分解纤维素的能力就强）
方法二，在倒平板时就加入刚果红
配制质量浓度为10 mg/mI的CR溶液，灭菌后，按照每200 mI。培养基加入1 mI。的比例加入CR溶液，混匀后倒平板。等培养基上长出茵落后，产生纤维素酶的菌落周围将会出现明显的透明圈
两种刚果红染色法的比较 : 刚果红在筛选纤维素分解菌上的应用已经有超过20年的历史，课本中给出了两种方法。
方法一是传统的方法，
优点：这样显示出的颜色反应基本上是纤维素分解菌的作用。
缺点：操作繁琐，加入刚果红溶液会使菌落之间发生混杂；
方法二
优点：操作简便，不存在菌落混杂问题，
缺点1：由于在纤维素粉和琼脂、土豆汁中都含有淀粉类物质，可以使能够产生淀粉酶的微生物出现假阳性反应。但这种只产生淀粉酶的微生物产生的透明圈较为模糊，因为培养基中纤维素占主要地位，因此可以与纤维素酶产生的透明圈相区分。
缺点2：有些微生物具有降解色素的能力，它们在长时间培养过程中会降解刚果红而形成明显的透明圈，与纤维素分解菌不易区分
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