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基因组大杂烩,人类有上百个外来基因

2015.3.16

  从细胞中的遗传物质来看,我们大家都不完全是人类。最近科学家们发现,人类基因组中有145个基因来自细菌、病毒和其它单细胞生物。研究指出,在漫长的进化过程中,许多其他分支的基因成为了动物细胞的一部分。

  “从这方面看,生命之树更像是一颗盘根错节的亚马逊绞杀植物,”文章的作者之一,剑桥大学的生物学家Alastair Crisp说。

  水平基因转移在细菌和简单真核生物中是很常见的,这些生物能够通过这一途径快速分享抗性基因,对抗生素治疗进行抵抗。不过,灵长类等高等生物中的水平基因转移一直存在争议。要证明人类基因组中的一段DNA来自另一种生物,是一项比较困难的工作。

  Crisp及其同事对四十种动物的基因组序列进行了分析,包括果蝇、线虫、斑马鱼、大猩猩、人类等等。他们在数据库中搜索每一个基因,在其他动物、植物、真菌、细菌和病毒中寻找与之匹配的片段。这项研究发表在三月十二日的Genome Biology杂志上。

  研究显示,这些动物中有数百个基因来自其他动物、植物、细菌、古生菌、真菌和其他微生物。人类基因组中有145个基因是从更简单的生物水平转移来的。“这说明水平基因转移不仅限于微生物,也在动物的进化中起到了一定的作用,” Crisp说。

  这些外来基因主要在代谢、免疫应答和基础生化反应中起作用。不过这篇文章并没有阐明水平基因转移是如何发生的,也没有给出准确的时间,这些问题还有待于进一步的研究。

  这项研究为人们提供了关键性的进化线索,“这是一篇很棒的文章,他们使用了能找到的所有最新数据,以及数据库中的所有基因组,揭示了进化过程中的生物间基因转移,”美国西北大学的分子生物学家Hank Seifert说。

  不过,这项研究也并非没有争议。“我并没有看到特别令人信服的证据,”加州大学的微生物学家Jonathan Eisen说。他并不否认细菌和动物之间可能发生水平基因转移,但认为这项研究还没有完全排除其他解释。

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