1分钟了解占据等温PCR三成市场的NEAR技术
小背景
切刻酶辅助扩增反应,可以有以下几种称呼:
NEAR,nicking enzyme-assisted reaction;
NEAA,nicking enzyme-assisted amplification;
NEMA, nicking enzyme-mediated amplification;
EXPAR,Exponential amplification reaction。
该技术由Ionian Technologies, Inc.于2000年发明;2010年被Alere收购;2017年被雅培收购。是的,该技术就是雅培推出5min获得新冠检测结果ID NOW的核心技术。
NEAR技术目前已经得到比较广泛的应用
图片来源:C.Qian,et al./Analytica Chimica Acta, 2019
该系统的核心组成:
Nt.BstNBI切刻内切酶
能特意的识别DNA序列5’-GAGTC-3’/5’-GACTC-3’,并且仅仅在距离识别位点3’端4个核苷酸的位置切割含有识别序列的单链DNA。 切刻内切酶,最早发现于1988年,后续又有不同的切刻内切酶被发现,以及工程菌被开发。不同的内切酶识别序列和切割位置可能会有不同。如下图,是列举的部分切刻内切酶相关信息。
部分切刻内切酶相关信息
图片来源:C.Qian,et al./Analytica Chimica Acta, 2019
链置换DNA聚合酶
该聚合酶可以以DNA双链的一条链为模板进行新链的合成,新合成的链替换旧双链中的序列相同的旧链,即链置换。 可以选择不同的具有相同功能的链置换DNA聚合酶,如Bst、Klenow、Vent等DNA聚合酶。
引物
操作原理:
NEAR技术原理模式图
注意事宜:
基于核心原理,可以有不同的展现形式,万变不离其宗!
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