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北京基因组所资源建设取得阶段性进展

2017.11.03

  近日,中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心团队以Database Resources of the BIG Data Center in 2018为题的研究论文,在线发表Nucleic Acids Research上。这是继去年首次在该期刊发布我国生命组学数据资源建设成果The BIG Data Center: from deposition to integration to translation后又一阶段性重要进展,标志着我国建设综合型生物信息资源库进一步获得国际同行认可。

  北京基因组所生命与健康大数据中心面向国家大数据发展战略,承担着建成多层次生物组学数据资源系统,建设组学大数据汇交共享平台,并建立多组学生物大数据资源体系的重要任务。北京基因组所生命与健康大数据中心在原有多组学资源库基础上,添加建立了四个新库,包括生物信息工具代码库(Biological Tool Codes,BioCode)、生物项目数据库(Biological Project Library,BioProject)、生物样本数据库(Biological Sample Library,BioSample)、内参基因知识库(Internal Control Genes,ICG)。同时,更新了原有的多个数据库,包括原始测序数据归档库(Genome Sequence Archive,GSA)、基因表达数据库(Gene Expression Nebulas,GEN)、基因组变异数据库(Genome Variation Map,GVM)、表观基因组数据库(Methylation Bank,MethBank)、生命科学维基知识库(Science Wikis)。此外,推出了三个特色网络服务,跨库检索服务BIG Search、统一认证与单点登录服务BIG SSO、生物数据提交服务Gsub。其中,BIG Search可对大数据中心内部数据库进行多库检索,并实现了多单位的跨库检索,包括北京大学(LncRNADisease)、天津大学(DoriC,DEG)、华中科技大学(AnimalTFDB,dbPAF,lncRNASNP,PLMD)的多个重要数据库。

  研究工作得到中科院战略性先导科技专项、中科院国际大科学计划、国家高技术研究发展计划(863计划)、国家重点基础研究发展计划(973计划)、国家自然科学基金、中科院百人计划等的资助。

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生命与健康大数据中心核心数据资源

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