解析了康复者免疫记忆形成的表观遗传机制
2021年6月9日，Nature Cell Biology在线发表了题为Single-cell epigenomic landscape of peripheral immune cells reveals establishment of trained immunity in individuals convalescing from COVID-19 的文章。该工作通过单细胞ATAC-seq技术以及新开发的单细胞多组学Ti-ATAC-seq技术，描绘了新冠肺炎康复者外周免疫细胞可接近染色质多维图谱，解析了康复者中单核细胞、B细胞和T细胞免疫记忆形成的表观遗传机制。
在某些病毒感染或者疫苗接种后人体能诱导天然免疫细胞表现出类似于适应性免疫细胞的免疫记忆特征，也就是“训练有素的免疫力（trained immunity）”。该研究结果表明，新冠肺炎康复者的天然免疫细胞和适应性免疫细胞都发生了大量的染色质重塑。康复者外周血中富集了TBET-enriched CD16+和IRF1-enriched CD14+ 单核细胞，经确定具有训练有素（trained）和激活的表观状态。在B细胞谱系分析中，新冠肺炎康复者各个阶段的B细胞表现出IgG类别转换以及抗体分泌的浆细胞样分化特征。
在T细胞谱系分析中，研究者新建了一个单细胞多组学Ti-ATAC-seq新技术，可以同时在单细胞水平获取每个T细胞的可接近染色质信息，TCR序列，以及细胞膜分子表达水平。新冠肺炎康复病人中CD8+ T细胞表观遗传图谱和单细胞TCR克隆深入分析揭示了病毒诱导的效应CD8+ T细胞在初始新冠病毒控制和记忆CD8+ T细胞在免疫记忆形成中发挥了关键作用。
该论文杨鹏远、Mark M Davis和陈亮为共同通讯作者，游茂军为第一作者。
值得一提的是，在同期Radboud University Nijmegen Medical Centre的Mihai G. Netea和Yang Li 针对该文章发表了评论文章Immune memory in individuals with COVID-19。
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