在这篇文章中,Christensen等人在一组30个胶质母细胞瘤样品中,分析了包括5-甲基胞嘧啶(5mC)和5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)在内的多个DNA修饰,“健康个体与疾病患者体内不同DNA修饰详细功能,引发了大家的关注。在这篇文章中,我们揭示了胶质母细胞瘤中特殊的DNA 5mC和5hmC模式,以及基因组中被称为‘增强子’的分子开关的特殊特征。而且更重要的是,我们发现 5hmC 与患者存活率之间的重要关系,”Christensen说。

之前的技术局限性限制了研究人员,无法同时高分辨率分析癌症基因组中的5mC 和5hmC 水平。这项新研究利用先进的分子生物学和统计学方法,比如他们的Discovery Computing Cluster 和 Nano String nCounter,分析了基因组关键区域中的DNA修饰水平。

“结合这些方法,我们发现了表观基因组对癌症的更多影响,以及5hmC不同的功能作用,”Christensen说。