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III型-A CRISPR-Cas系统改造耐药金黄色葡萄球菌的基因组

2021.1.24

  CRISPR-Cas系统是古细菌及其他细菌的获得性免疫系统,是细菌为了抵御外源基因入侵而形成的自我保护机制。根据CRISPR相关蛋白(CRISPR-associated proteins ,cas)的结构和功能,将为CRISPR-Cas系统分为5个类型,其中I 型、 II型和III型CRISPR-Cas系统最近研究较多。已有研究表明III型CRISPR-Cas系统由9个cas蛋白(包括cas和csm)和间隔序列(spacer)组成,其中Cas10是参与crRNA的成熟和剪切入侵外源DNA的特征蛋白。孙宝林课题组在之前研究发现6株临床分离株(S. aureus AH1, AH2, AH3, SH1, SH2, 和SH3)含有III型-A CRISPR-Cas系统,且对系统中重复序列研究发现它们具有较高保守性。此外,与I 型和 II型 CRISPR-Cas 系统较大不同, III型CRISPR-Cas系统不需要PAM(protospacer adjacent motif)序列,但其crRNA 5’-tag序列(ACGAGAAC)发挥着同样的作用。孙宝林团队便利用其中一种社区获得性耐药金黄色葡萄球菌(S. aureus AH1)自身所具有III型-A CRISPR-Cas系统来设计实现对其基因组进行剪切。


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