高福同时还担任中科院病原微生物与免疫学重点实验室主任，主要研究领域包括病原微生物跨种间传播机制与结构免疫学，长期致力于禽流感等动物源性病原跨种传递的机制的研究。他认为，从SARS到高致病性H5N1禽流感病毒再到H7N9的研究成果，也凸显出中国科研在该领域的发展与进步。

　　针对有传言称"来无影、去无踪"的SARS病毒"当年可能是敌对国家对中国实施生物恐怖袭击"的说法，高福并不认同，他说，制造一种"只感染别人、不感染自己"的病毒的技术，目前还没有可能发明出来。